从建国以后开始研究。计划经济体制下，我国医院收支极不平衡，医院收费非常低廉，所收的费用远低于实际的成本，而医院的亏损由国家进行补贴。也就是说，当时的医院并不进行经济预算，亏损都由国家来承担。但是这种情形下，医院的亏损远大于国家的补贴，所以医院的亏损情况越来越严重，医疗事业的发展也陷入困境。改革开放以后，国家开始进行卫生改革，实行了分级的收费制度，对于特定的医疗器械使用、新医院的开放等可以收费。直到1988年《医院财务管理办法》的施行，确定了将医院纳入差额预算管理的范畴。1998年，新的《医院财务制度》施行，医院开始采取了核定收支、定额补助的预算管理方法。，《医疗机构财务会计内部控制规定（试行）》颁布实施，该规定一直沿用至今。
