我们都知道，舰载的通用垂直发射系统是海军武器的一次革命，垂发系统配置更加灵活，反应速度快，能够适应多种任务，隐身性能更好，外形更简洁。
但很多军舰在配备垂直发射系统后，还要单独放置反舰导弹发射系统，例如美国提康德罗加级导弹巡洋舰、阿里伯克级导弹驱逐舰和中国的052C型导弹驱逐舰，这引起很多军迷的疑问。其实这个没有标准答案，每个国家的国情不同，只能具体分析。
例如这是美国海军9600吨的导弹巡洋舰伊利湖号，该舰是美国海军太空拦截的主力，2月20日，该舰发射一枚SM-3导弹成功击中一颗失控间谍卫星USA193。按理说如此巨大的军舰，将反舰导弹采用垂直发射装置，舰艇内的空间完全足够，但反舰作战并非该舰的主要任务，单独为反舰导弹垂直发射研制垂发装置或改装导弹，显然不经济，所以美国人随便在舰尾找个角落安置了鱼叉导弹。
中国的052C型导弹驱逐舰安装了前6后2的8组海红旗-9舰空导弹垂直发射熊，总携带量48枚。也是没有把反舰导弹设计成垂直发射的，在舰体中部安装了两座4联装倾斜发射的鹰击-62反舰导弹。到了052D型驱逐舰，才为鹰击-18反舰导弹与红旗-9舰空导弹设计了共架发射的通用垂直发射系统。
反舰导弹是否使用垂直发射系统，在技术上不存在问题，只是没有这个需求。反舰导弹最好的突防方法是超低空掠海飞行，一般升空之后就进入低空巡航攻击阶段，为的就是隐蔽。因此要保证整个攻击过程的隐蔽，垂直发射的导弹都是先往高空打，垂直转水平飞行的过渡段弹道太高，容易暴露，倾斜发射就很合适，也不需要对导弹进行任何改造，比较经济。
反舰导弹的尺寸问题也是制约采用垂直发射的主要因素。需要穿透很多层甲板。例如中国的鹰击18反舰导弹，长度达到了8.2米，俄罗斯宝石导弹和印度布拉莫斯导弹的长度更是高达8.9米，尺寸远远超过普通亚音速反舰导弹，中国鹰击83和美国鱼叉导弹的长度都只有5米。这样就限制了鹰击18反舰导弹垂发系统的应用，只能安装在大中型水面舰艇上。
