近日，安徽农业大学生命科学学院蔡永萍教授团队在国际学术期刊Frontiers in genetics发表题为“RIGD: A Database for Intronless Genes in the Rosaceae”的研究论文，研究在蔷薇科无内含子基因领域取得了重要进展。
大多数真核基因包含一个或者多个内含子，只有原核基因组主要由单外显子基因组成，而没有内含子。由于缺乏内含子，真核生物中的无内含子基因已成为比较基因组学和进化生物学的重要材料。尽管存在许多有关外显子和内含子的数据库，但目前尚没有将蔷薇科植物中无内含子基因收集到一个数据库。在这项研究中，蔡永萍团队构建了蔷薇科无内含子基因数据库（RIGD），该数据库有一个友好的Web界面，用于探索和收集来自不同植物的无内含子基因信息。RIGD的当前版本中包括6个蔷薇科物种，Pyrus bretschneideri，Pyrus communis，Palus domestica，Prunus persica，Prunus mume和Fragaria vesca。这项研究的主要目的是提供基因序列数据，并对这些基因进行了功能注释，亚细胞定位预测和GO分析。RIGD可以使用户轻松浏览，搜索和下载数据。通过此在线数据库还可以用于Blast比对和比较基因组学分析，该数据库可从/获得。
安徽农业大学生命科学学院硕士研究生陈天哲和博士研究生孟丹丹为论文并列第一作者。蔡永萍教授为通讯作者，中南林业科技大学曹运鹏博士为论文的共同通讯作者，该研究得到了清华大学和华中农业大学相关人员的帮助和支持。
论文链接：
/articles/10.3389/fgene..00868/full
