病菌主要以菌核落入田间或在病稻草、杂草等寄主上越冬,第二年插秧后随灌水流动附着在幼苗近水面处,产生菌丝侵入植株,潜育期3~5天后发病。侵染最适宜温度为28~32℃、最宜湿度为96%以上。如果相对湿度在85%以下,则侵染受抑制。病菌对酸碱度的适应范围为pH4.5~6.7。
水稻纹枯病发生程度受菌源、气候、水稻抗病性和田间栽培管理几方面因素影响,在菌源充足,气候适宜时水稻纹枯病发生普遍,水稻不同生育期抗病能力不一致,种植制度和田间管理水平对纹枯病流行有一定影响,在水稻纹枯病流行高峰前进行药剂防治,是控制水稻纹枯病的关键时期。
植株生长过于繁茂,密度大,荫蔽潮湿的田间易发生。