云纹状病斑是小麦纹枯病的典型症状。小麦发芽后，芽鞘受病菌侵染后变褐死亡。幼苗一出土，其根茎、叶鞘即可受害，多在3～4片叶时表现症状。发病初期，在近地表的叶鞘上产生淡黄色小斑点，后发展成典型的黄褐色梭形或眼点状病斑。病部逐渐扩大，颜色变深，并向内发展延及茎秆，基部茎节腐烂，幼苗不抽新叶，猝倒而死亡；小麦生长中后期，叶鞘上的梭形病斑联合，呈云纹状，中间淡黄褐色，全文。
幼苗发病，初期在第一片叶与芽鞘之间有针尖大小的小黑点，随后蔓延到叶鞘和叶片上，呈梭形褐边白斑并有虫粪状物。拔节期在叶鞘上形成褐色云斑，边缘明显，病斑上有灰黑色虫粪状物，叶鞘内有一层白色菌丝。有的茎秆内也充满菌丝。叶片下垂卷曲。抽穗后叶鞘内菌丝变为灰黑色，叶鞘表面有明显突出小黑点（子囊壳），茎基部干枯或折倒，形成枯白穗，籽粒秕瘦。
