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短短7天 中国学者们在《Nature》上发表论文13篇 为他们喝彩!

时间:2018-10-12 19:21:27

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短短7天 中国学者们在《Nature》上发表论文13篇 为他们喝彩!

就在这短短的7天,中国/华人连续发表了13篇Nature,我们现在就重点介绍这些成果:

3月6日,清华大学江鹏团队在Nature在线发表题为“p53 regulation of ammonia metabolism through urea cycle controls polyamine biosynthesis”的研究论文,该论文报告肿瘤抑制因子p53,人类肿瘤中最常见的突变基因,通过抑制尿素循环来调节氨代谢。通过CPS1,OTC和ARG1的转录下调,p53在体外和体内抑制尿素生成和氨的消除,导致肿瘤生长的抑制。相反,这些基因的下调通过MDM2介导的机制相互激活p53。此外,氨的积累导致多胺生物合成速率限制酶ODC的mRNA翻译显著下降,从而抑制多胺的生物合成和细胞增殖。总之,这些发现将p53与尿素生成和氨代谢联系起来,并进一步揭示了氨在控制多胺生物合成和细胞增殖中的作用;

3月6日,德克萨斯大学西南医学中心陈志坚,Bai Xiao-chen及Zhang Xuewu共同通讯在Nature在线发表题为“Structural basis of STING binding with and phosphorylation by TBK1”的研究论文,该论文揭示STING与TBK1结合的结构基础,以及STING磷酸化的机制。

该研究提出了一种模型,其中STINGG的cGAMP诱导的高级寡聚化提供了用于募集和激活TBK1的信号传导平台。 在STING寡聚体中,一些C末端尾部募集TBK1,其使邻近的STING分子的尾部磷酸化。 STING中的磷酸化363LXIS366基序构成IRF3结合基序,其通过TBK1募集IRF3用于磷酸化。 STING的磷酸化尾部可同时与TBK1和IRF3结合,从而将IRF3递送至TBK1以进行磷酸化;

3月6日,德克萨斯大学西南医学中心陈志坚在Nature在线发表题为“Autophagy induction via STING trafficking is a primordial function of the cGAS pathway”的研究论文,该论文揭示STING还通过独立于TBK1激活和干扰素诱导的机制激活自噬。在结合cGAMP后,STING在依赖于COP-II复合物和ARF GTP酶的过程中易位至内质网 - 高尔基体中间隔室(ERGIC)和高尔基体。因此,自噬诱导是cGAS-STING途径的古老且高度保守的功能,其早于脊椎动物中I型干扰素途径的出现;

3月6日,德克萨斯大学西南医学中心陈志坚,Bai Xiao-chen及Zhang Xuewu共同通讯在Nature在线发表题为“Cryo-EM structures of STING reveal its mechanism of activation by cyclic GMP–AMP”的研究论文,该论文得到了人类和鸡的全长STING,处于无活性的二聚体状态(大小约80kDa),以及二聚体和四聚体状态的cGAMP结合鸡源STING冷冻电子显微镜结构。这对于进一步了解STING信号转导有积极的意义;

在2月27日,同时有9篇Nature文章是有中国学者/华人发表的,具体的成果如下面所介绍:

北京生命组学研究所贺福初,复旦大学附属中山医院樊嘉,国家蛋白质科学中心钱小红共同通讯发表题为“Proteomics identifies new therapeutic targets of early-stage hepatocellular carcinoma”的研究论文,该研究使用蛋白质组学和磷酸蛋白质组学分析,发现110个与乙型肝炎病毒感染相关的临床早期肝细胞癌的成对肿瘤和非肿瘤组织。定量蛋白质组学数据突出了早期肝细胞癌的异质性:研究人员使用它来将该队列分层为亚型S-I,S-II和S-III,每种亚型具有不同的临床结果。本研究中提出的早期肝细胞癌的蛋白质组学分层,提供了对该癌症的肿瘤生物学的深入了解,并提出了针对它的个性化治疗的机会(点击阅读);

第三军医大学(陆军医科大学)卞修武,刘新东及清华大学董晨等人共同通讯发表题为“Genome-wide analysis identifies NR4A1 as a key mediator of T cell dysfunction”的研究论文,该论文使用小鼠体外T细胞耐受诱导系统,研究人员发现耐受性T细胞中的全基因组表观遗传和基因表达特征,并表明它们不同于效应和调节性T细胞。值得注意的是,转录因子NR4A1在耐受性T细胞中以高水平稳定表达。 NR4A1的过表达抑制效应T细胞分化,而NR4A1的缺失克服了T细胞耐受性并夸大了效应功能,以及增强对肿瘤和慢性病毒的免疫力。该研究将NR4A1鉴定为诱导T细胞功能障碍的关键一般调节因子,并且是肿瘤免疫疗法的潜在靶标(点击阅读);

康涅狄格大学&温州医科大学&华中农业大学阮一骏团队发表“Multiplex chromatin interactions with single-moleculeprecision”,描述了一种多重染色质相互作用分析的策略,称之为ChIA-Drop;证明了ChIA-Drop在捕捉复杂的染色质相互作用的单分子精确性,这是不可能基于群体水平两两接触的方法测定。在果蝇中发现,染色质的拓扑结构主要由具有高度异质性的多重染色质相互作用组成;ChIA-Drop还揭示了以启动子为中心的多价相互作用,从而提供了对转录的拓扑观察(点击阅读);

划重点:3篇Nature背靠背

中国科学院物理研究所方辰,翁红明共同通讯发表题为“Catalogue of topological electronic materials”的研究论文,该论文介绍了一种有效,高效和全自动的算法,可以诊断大部分非磁性材料中的非平凡带拓扑。该研究的算法是基于最近开发的占用带的对称表示和拓扑不变量之间的穷举映射。研究人员在水晶数据库中扫描了总共39,519种材料,发现其中多达8056种材料在拓扑上非常重要。所有结果均可在具有交互式用户界面的数据库中搜索(点击阅读);

南京大学万贤纲发表题为”Comprehensive search for topological materials using symmetry indicators“的研究论文,该论文将对称指示器的方法应用于所有230个可能空间群中的所有合适的非磁性化合物。数据库搜索显示了数以千计的候选拓扑材料,其中研究人员突出了241个拓扑绝缘体和142个拓扑结晶绝缘体,这些绝缘体具有明显的全带隙或相当大的直接间隙以及小的琐碎费米口袋。此外,研究人员列出了692个具有位于费米水平附近的带交叉点的拓扑半金属。这些候选材料开辟了在下一代电子设备中使用拓扑材料的可能性(点击阅读);

普林斯顿大学/中科院物理研究所王志俊及普林斯顿大学B. Andrei Bernevig共同通讯发表题为”A complete catalogue of high-quality topological materials“的研究论文,该研究开发代码来计算26,938个化学计量材料的所有对称性的所有特征,并找到3,307个拓扑绝缘体,4,078个拓扑半金属且没有脆弱相。 对于这7,385种材料,研究人员提供电子能带结构,包括一些电子特性(带隙和电子数),对称性指标和其他拓扑信息。 研究结果表明,自然界中超过27%的材料是拓扑学的。 该研究提供了一个开源代码,用于检查任何材料的拓扑结构,并允许其他研究人员重现该研究的结果(点击阅读);

划重点:3篇Nature背靠背

加州大学伯克利分校王枫团队发表题为“Observation of moiré excitons in WSe2/WS2 heterostructure superlattices”的研究论文,该论文报告了在二硒化钨/二硫化钨(WSe2 / WS2)异质结构中的莫尔超晶格激子态的观察,其中层紧密排列。莫尔激子带提供了一个有吸引力的平台,可以从中探索和控制物质的激发态,例如在过渡金属二硫化物中,拓扑激子和相关的激子哈伯德模型(点击阅读);

华盛顿大学Xu Xiaodong/香港大学Wang Yao发表题为“Signatures of moiré-trapped valley excitons in MoSe2/WSe2 heterobilayers”的研究论文,该研究报告了在二硒化钼(MoSe2)/二硒化钨(WSe2)异质层中捕获莫尔势的层间谷激子的实验证据。这些结果表明观察到的效应的起源是层间激子被捕获在光滑的莫尔势中,具有继承的谷对比物理学。这项工作提供了通过改变扭转角来控制二维莫尔光学的机会(点击阅读);

德克萨斯大学奥斯汀分校Li Xiaoqing/阿贡国家实验室Wu Fengcheng发表题为“Evidence for moiré excitons in van der Waals heterostructures”的研究论文,该研究报告了在具有小扭转角的二硒化钼/二硒化钨(MoSe2 / WSe2)异双层中的正或负圆极化发射的多个层间激子共振的观察。 这些结果表明使用范德瓦尔斯异质结构设计人工激子晶体用于纳米光子学和量子信息应用的可行性(点击阅读)。

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