有岛内媒体报道，台湾当局“行政院”在度总预算中，独缺“蒙藏委员会”预算，更传今年底该机构将遭到裁撤。对此，台“行政院”发言人徐国勇15日证实，“蒙藏委员会”年底前将裁撤，未来蒙藏相关业务及49名职员将移拨“文化部”和陆委会，这些职员到新单位后的业务也会是跟蒙藏有关。
徐国勇表示，因总预算案须于8月底前送“立法院”，且不再编列“蒙藏会”相关预算，为周延起见，规划在总预算案送出前，将先把废止“蒙藏委员会组织法”送立法院审议。
据台湾“中央社”报道，民进党籍“立委”林俊宪在脸书发文称，度“蒙藏委员会”就编列人事费用7400多万（新台币，下同），正职员额加上驻警、工友、技工、驾驶等合计63人，平均每人年薪都破百万；“蒙事业务”与“藏事业务”加起来也才3000万出头，不到人事费用的一半。林俊宪说，人事与业务经费比例之合理性，与社会大众认知有所落差，难免招致公论。年年编列、年年挨骂、年年当肥猫，“这样的“蒙藏委员会”，早就该裁撤了”。
据香港中评社报道，对于“蒙藏委员会”将被裁撤，国民党籍“立委”陈学圣表示，这确实是一个“去中国化”的动作，民进党当局早就想做，但不敢明目张胆做，就“挪移”一些步伐，但实际上是往废除的路上走，因现在内政、两岸关系都不好，只能慢慢移动，但废除的目标没有改变。
陈学圣表示，为什么两岸关系处不好，因两岸一直没有互信基础，蔡英文当局希望两岸重启对话，但常常有新问题出现，如课纲中把“中国史”放在“东亚史”，“中华奥委会”改名“国家奥委会”，以及现在的裁撤“蒙藏委员会”等等，两岸怎可能复谈？
国民党“立法院”党团总召林德福表示，蔡英文既然一直说要“维持现状”，就不要任意“改动”，过去“蒙藏委员会”都维持，现在配合“台独”人士的思维和作法，这个并不是非常妥当。 林德福呼吁蔡英文当局不要搞“法理台独”，民众是希望“维持现状”，跟大陆友好互动，“每天搞小动作意义不大”；如何让经济提升，两岸间取得和平共识，这才是民众希望看到的样子。
前“蒙藏委员会委员长 ”高思博则分析认为，“蒙藏委员会”业务将来移拨至哪个机构，攸关蔡当局如何看待整体大陆政策有关。马当局时代规划在陆委会辖下成立“蒙事处”与“藏事处”处理蒙藏相关业务，视为整体“大陆事务”一环。蔡当局若将多数业务与人员并入“文化部”，规划意涵就跟国民党时期有很大的不同。显然是想降低或根本性去除蒙藏事务属于“大陆事务”的意涵。
据了解，“蒙藏委员会”源自于北洋政府时期“内务部蒙藏事务处”，后改隶于国民政府“行政院”辖下，并设置“蒙藏委员会”，是国民政府管理蒙藏事务的最高机构。国民政府时期，“蒙藏委员会”在维护国家主权和边疆民族稳定方面发挥了积极意义。国民党败退台湾后，依旧设有“蒙藏会”，被视为“部会”机关，平常业务不多，但有象征意义在。因而，在很多台湾人看来，“蒙藏委员会”是一个“只吃饭不千活”、专门“搜刮民脂民骨”的“政府机构”，做的事情很少，却一直花着政府的税款。
对于岛内“蒙藏委员会”撤废争议，国台办新闻发言人安峰山曾表示，我们对台湾方面的内部调整不做评论，但是坚决反对借内部调整为名去搞“去中国化”的“台独”分裂行径。
