文昌帝君和梓潼帝君之来源本非一事。“文昌”来源于上古国家祭祀及星占体系中北斗星座中六星组成的“文昌宫”。文昌六星各有所司，其中“贵相”主文绪，“司命”主老幼，“司中”主灾咎，地位较为重要，在民间信仰中也有很大影响。主掌死生的“司命”独立被道教借用，成为其仙真谱系中的重要神灵。文昌作为星神引入到道教中，最初是以主掌仙籍为主，并无其他显著职能。
“梓潼帝君”则是源自于三国西晋时四川梓潼县一带的一个地方神信仰，传说此神名张亚子，有记载谓其仕晋战死，乡人立庙以祀。张亚子信仰至唐代因入蜀二帝玄宗、僖宗分别予以敕封而影响渐大；至宋代，梓潼张亚子神和灌口二郎神成为四川地区影响最大的两个俗神。
同时，由于张亚子庙位于由长安入蜀必经之道，过往士人纷纷往祀，“士大夫过之，得风雨送，必至宰相；进士过之，得风雨，必至殿魁”，渐渐成为专司功名仕进之神。元明间道士先后编撰出《元始天尊说梓潼帝君本愿经》、《元始天尊说梓潼帝君应验经》（或是前者的节录）、《清河内传》、《梓潼帝君化书》等经，将其引入道教，称其灵应无所不至。
宋元之间屡受敕封，元仁宗延祐三年封为“辅元开化文昌司禄宏仁帝君”，明代亦以“文昌”名其宫观，并于学宫皆立文昌祠，文昌祠则祀梓潼帝君。由此“梓潼帝君”与“文昌星神”合二为一，或称文昌帝君，或称梓潼帝君，成为社会一般信仰中文章、科举的守护神。
有意思的是，旧时文昌庙中的文昌帝君塑像，大多有名为“天聋”、“地哑”二童子像陪侍左右，这是因为“真君为文章之司命，贵贱所系，故用聋、哑于侧，使其知者不能言，言者不能知，天机弗泄也”。这些深刻地反映出中国古代社会渴望通过读书应举以求公平实现阶层转化的普遍心态。
古人有“字乃神传授”，如宋朝王沂公，其父见字纸遗落坠地，必捡起来以香汤洗净烧之，一夕梦文昌帝君拊其背曰：“你为何对我的字纸如何敬重！只可恨你已经老了，没有什么成就，他日让曾来你家托生，让你家名户大显。过了没多久，王父家果然生了男婴，于是给他取名曾，后来真的状元及第，王家名声大显。
所以儒家常常拖文昌帝君之文，劝诫天下的文人要“敬惜字纸”。他说现在的人，虽然读书念字，却不懂爱惜文字书籍，不是拿来糊墙，就是拿来踩踏，或者拿来擦拭。这样的人，即是读一辈子书也没什么成就的。
