中医认为南瓜性温味甘，入脾、胃经。具有补中益气、消炎止痛、解毒杀虫的功能。可用于气虚乏力、肋间神经痛、疟疾、痢疾、解鸦片毒、驱蛔虫、支气管哮喘、糖尿病等症。
1、预防前列腺：南瓜种子中的脂类物质对泌尿系统疾病及前列腺增生具有良好的治疗和预防作用。 2、常吃南瓜，可使大便通畅，肌肤丰美，尤其对女性，有美容作用。 3、南瓜还可以预防中风，因南瓜里含有大量的亚麻仁油酸、软脂酸、硬脂酸等甘油酸，均为良质油脂。 4、保护胃粘膜：促进胆汁分泌，免受粗糙食品刺激，加强胃肠蠕动，帮助食物消化。
5、降血糖降血压：调节胰岛素的平衡，维持正常的血压和血糖，也是肥胖者的理想减肥食品。 6、防癌治癌：预防食管癌和胃癌，对防止结肠癌也有一定的功效，同时能帮助肝、肾功能的恢复，增强肝、肾细胞的再生能力。
南瓜不可和羊肉一起吃，这两种食物都是热性之物，一起吃可能会导致腹胀、便秘等等一些疾病。患感染性疾病和发热症状者不宜食用，以防病情恶化。 南瓜不可虾一起吃，虾肉中含有多种微量元素，与南瓜同时食用，能与其中的果胶反应，生成难以消化吸收的物质，导致痢疾。可以用黑豆、甘草解毒。
