一、价格问题
1.政策不统一，各国监管有差异，关税负担大。很多网跨境电商购物给用户带来的快乐乐趣，也有的带来的价格的问题，很多网上购物由于政府政策不统一，各国监管有差别，使得很多网跨境电商商品因关税、商品定价异常等原因，购物者在购买商品时可能面临不小的负担。
2.促销活动较少，价格上缺少竞争力。除了网络购物本身货品价格较高问题外，同样由于我国政府政策不统一，网跨境电商促销活动比较少，相比本地购物及时店家，消费者无法从更多的促销和优惠商家收益，从而在价格上缺乏竞争力。
二、物流问题
1.物流成本费用较高。由于国际物流运输的复杂性，贸易企业平均货物费用头低于本地商家，因此，网跨境电商的物流成本较高，特别是发货时长比较长的国际物流，成本费用将更高。
2.收货时间较长。出于国际物流运输因素，网跨境电商货物时长较长，收货时间为1~2个月之间，具体货物发货时长是不定的，使消费者在进行网跨境购物的是要耐心的等待。
三、管理问题
1.支付系统不方便。目前国内网跨境电商支付系统有进步，但其和国际贸易支付系统相比较，还有差距，而网跨境电商支付上还特别受限，支持的支付方式和种类都不多，有不少企业和支付宝等平台接入，但多数企业把主攻客户端支付，无法支持站外购物，因此，网跨境电商支付系统和国外支付系统相比仍然有不小的差距。
2.安全管理存在问题。网跨境电商的安全管理一直以来是一个比较棘手的问题，主要原因是境外网站服务器基本上都在国外，国内权威机构对境外网站无法对其进行监管，因此，网跨境电商存在一定的线上风险敞口，加上一些商家手法不正规，不少消费者的利益受损。
四、地理位置问题
1.知名度较低。由于网跨境电商服务客户的多样性，全国各地的地理位置以及经济社会环境的不同，以及支持的支付系统的限制，使得一部分消费者没有用这些服务。
2.物流受限。由于国际物流运输的客观条件，部分地区消费者将无法在网跨境电商购物，其物流受地理位置所限，而另一部分消费者将面临更长的收货时间，可能会出现货物未能完成运输的情况。
一、敦煌网跨境电商安全性较差
敦煌网跨境电子商务安全系统不够完善，用户在访问和交易过程中可能出现安全问题，例如：信息可能被篡改，敏感信息可能会泄露。
二、敦煌网跨境电商在用户体验上欠缺
敦煌网跨境电子商务并没有给用户提供完善的服务，用户可能在网页不能很好的进行浏览，处理的某些功能不能很好的进行操作。
三、敦煌网跨境电商对流量控制差
敦煌网跨境电子商务网站在流量上可能出现种种压力，比较容易发生崩溃，这就会影响用户的浏览，影响到了交易活动的进行。
四、敦煌网跨境电商扩展性较差
由于敦煌网跨境电子商务的软件可能没有完善，使用户无法对其布局和扩展性进行优化，这就给用户带来了一些不便，也阻碍了用户的体验。
五、敦煌网跨境电商技术支持不及时
敦煌网跨境电子商务的技术支持不够及时，用户在使用过程中有问题时，可能无法及时得到解决，这就使得用户无法得到满意的交易体验。
六、海外仓存管理比较低效
敦煌网跨境电子商务相对于国内电子商务，其仓储管理上可能要求比较复杂，而能够处理这些工作的商户比较少，也比较少，这使得这一项服务效率较低。
