鉴于鸡的生理特点，鸡摄入的饲料并没有完全消化吸收，约有40％－70％的营养物被排出体外，因此鸡粪在所有禽畜粪便当中养分是最高的。但是鸡粪不被处理或腐熟而直接施用到作物上，则存在很大的害处及隐患：直接施在土壤中，在合适条件下发酵并产生大量的热量，烧毁作物根系。同时鸡粪本身带有大量病菌，给作物带来病害隐患。因此须将鸡粪进行无害化处理和完全腐熟后才能施用于作物。
传统方法是将鸡粪密封堆沤，进行厌氧发酵，一般要3－4个月才能腐熟，现在通过生物技术，采用好氧发酵，腐熟速度比传统的快10－20倍，将鸡粪的蛋白质等大分子分解成小分子，作物可直接吸收。腐熟完全的鸡粪已基本闻不到臭味。
