原发性肝癌的病因及确切分子机制尚不完全清楚，目前认为其发病是多因素、多步骤的复杂过程，受环境和因此双重因素影响。流行病学及实验研究资料表明，乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV)感染、黄曲霉素、饮水污染、酒精、肝硬化、性激素、亚硝胺类物质、微量元素等都与肝癌发病相关。继发性肝癌(转移性肝癌)可通过不同途径，如随血液、淋巴液转移或直接侵润肝脏而形成疾病。
第一类是乙肝病毒感染者，就是表面抗原阳性的患者，但是病毒携带没有肝功能异常和病毒复制的人群，这些人群肝癌风险要远远高于没有感染乙肝病毒的患者;
第二个是有没有肝硬化，有肝硬化的患者是有非常高的肝癌风险的人群;
第三个就是抽烟酗酒的人群，肝癌的发生率和饮酒、吸烟等这些因素也有很大关系。
