猪伪狂犬病与猪乙脑病的鉴别诊断，对于出现神经症状的病例，临床诊断时应当把结合下述特点，进行鉴别诊断：
1、木乃伊胎儿：有木乃伊的考虑伪狂犬、蓝耳病和细小病毒病，而不考虑乙脑；
2、死胎、弱仔的头盖骨是否肥厚：肥厚的怀疑乙脑；
3、剖检死胎看前、后驱皮下水肿：后驱水肿的怀疑乙脑，前驱水肿的怀疑伪狂犬；
4、“过奶”“过料”的怀怀疑伪狂犬；
5、呕吐：母猪、育肥的中大猪有此症状怀疑伪狂犬；
6、剖检脑部病变：脑膜出血、水肿明显脑盖骨出血怀疑伪狂犬，脑组织出血、沟回间出血怀疑乙脑。
伪狂犬同圆环病毒的鉴别诊断本病同圆环病毒的临床区别一是看吻突，吻突半圆的顶端红肿、或有绿色至豇豆大小紫黑色淤血斑点的怀疑伪狂犬病毒感染，颜色深暗、触诊发凉的怀疑圆环病毒感染；二是看四肢下部或躯体皮肤是否有疖痘样溃点，有疖痘样溃点的怀疑圆环病毒感染；三是触摸腹股沟淋巴结，肿大的怀疑圆环病毒；剖检腹股沟淋巴结颗粒肿明显但呈白色的怀疑圆环病毒感染，不肿大但是表面呈灰色、红黄色或浅红色的怀疑伪狂犬病毒感染。
剖检对于胃部淤血、出血、溃疡病例，应注意溃疡部位：贲门区溃疡的怀疑圆环病毒感染，幽门区溃疡的怀疑伪狂犬病毒感染；肾脏的病变也明显不同：感染伪狂犬病例肾脏表现为多少不等的针尖出血点，而感染圆环病毒的则为绿豆大小的边缘整齐的白色坏死灶。
